期刊简介
江苏省预防医学领域首家公开发行的科技期刊,及时反映江苏省预防医学业务水平和学术水平,将江苏省及其它地区预防医学的先进技术、方法和最新信息反馈给各级预防医学工作者,是江苏省预防医学领域各学科进行学术交流的前沿阵地。内容侧重于预防医学领域内各学科的学术研究及方法探讨,兼顾基层工作者的实践经验交流。
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- 杂志名称:江苏预防医学杂志
- 主管单位:江苏省卫生厅
- 主办单位:江苏省疾病预防控制中心 江苏省预防医学会
- 国际刊号:1006-9070
- 国内刊号:32-1446/R
- 出版周期:双月刊
期刊荣誉:中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录:维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, 万方收录(中), CA 化学文摘(美)
中国新型布尼亚病毒分离株序列基因特征分析
刘秀兰;姚学君;管书慧;姜仁杰
关键词:新型布尼亚病毒, 基因特征, 序列分析, 流行病学特征
摘要:目的 分析中国新型布尼亚病毒分离株的基因型分布和进化规律,了解分子流行病学特征.方法 利用MEGA 6.0软件,对GenBank数据库收录的中国地区分离株的完整S片段基因序列进行分析,构建系统进化树,并分析毒株间的核苷酸和氨基酸的同源性.结果 在GenBank数据库收集到248株中国地区新型布尼亚病毒分离株,主要为人源毒株232株,占93.55%,核酸和氨基酸序列同源性分别为94.9%~96.8%和91.4%~95.2%;系统进化树分析显示中国地区流行优势株为C2基因亚型,占58.06%;5种亚型的核苷酸序列和氨基酸序列同源性为94.9%~96.8%、91.4%~95.2%,同亚型毒株核苷酸序列和氨基酸序列同源性为96.3%~99.1%、96.8%~98.6%.与汉坦病毒属和白蛉病毒属亲缘较远,毒株核苷酸序列同源性分别为39.3%~40.2%和47.3%~48.1%,氨基酸序列同源性13.6%~14.4%和22.5%~23.9%.人源毒株与宿主动物分离株高度同源,核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为96.3%~97.1%和94.0%~95.7%.结论 我国近年来新型布尼亚病毒流行毒株以基因亚型C2为主,存在多种基因亚型间循环交替流行.
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