期刊简介
江苏省预防医学领域首家公开发行的科技期刊，及时反映江苏省预防医学业务水平和学术水平，将江苏省及其它地区预防医学的先进技术、方法和最新信息反馈给各级预防医学工作者，是江苏省预防医学领域各学科进行学术交流的前沿阵地。内容侧重于预防医学领域内各学科的学术研究及方法探讨，兼顾基层工作者的实践经验交流。
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- 杂志名称：江苏预防医学杂志
- 主管单位：江苏省卫生厅
- 主办单位：江苏省疾病预防控制中心 江苏省预防医学会
- 国际刊号：1006-9070
- 国内刊号：32-1446/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录：维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, 万方收录(中), CA 化学文摘(美)
1株九江分离的柯萨奇A6病毒VP1基因分析及B细胞表位预测
徐焕新；柯秀梅；蔡曼；王萌；杨生晟；陈春辉；余文敏
关键词：柯萨奇A6病毒, VP1, B细胞抗原表位, 功能区, 二级结构, 信号肽, 跨膜区, 无规则卷曲, α-螺旋, β-片层
摘要：目的 对1株在九江地区分离的柯萨奇A6病毒(CoxA6) VP1区域进行克隆,并对其编码蛋白的结构、功能及B细胞表位进行分析和预测,为CoxA6疫苗制备和诊断方法的研究提供理论基础.方法 采用RT-PCR法对CoxA6分离株VP1区进行扩增和克隆、序列分析,应用SigaIP、TMPRED、TMHMM、Big-PI Predictor、Cell-Ploc、PSORT、NetNES、Netphos、SOPMA、NetNGlyc、MotifScan、InterProscan、SMART、PROSITE、GOR4、Bepipred Linear Epitope Prediction等生物信息学方法预测其VP1基因编码蛋白特性和潜在的B细胞表位.结果 该CoxA6分离株VP1基因编码305 aa的多肽,分子量为33.5 kDa.该蛋白无信号肽、跨膜区,是亲水性蛋白;二级结构主要以无规则卷曲为主,其次为α-螺旋及β-片层.该蛋白共有7个可能的B细胞抗原表位,位于151～ 173 aa区域内的表位分值高为2.774.结论 成功克隆了1株CoxA6的VP1基因,并对其进行序列分析、蛋白质结构和B细胞表位预测,为制备CoxA6疫苗和开发诊断方法提供了分子生物学基础.
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